O acesso a Porto Trombetas se dá, principalmente, por via aérea e fluvial.
O distrito conta com um aeroporto administrado pela própria MRN, que funciona regularmente com voos fretados, uma vez por semana, e com voos comerciais operados pela Azul às segundas, quartas e sextas.
As aeronaves fazem escalas em Manaus (AM) e Belo Horizonte (MG), de onde é possível seguir para outras partes do país.
No transporte fluvial, barcos e lanchas operam comercialmente com destino a Santarém, Óbidos e centro de Oriximiná.